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MES系统通常下有这几个功能模块：

1. 资源分配和状态管理

管理机床、工具、人员、物料、及其他设备与其他生产实体，用以保证正常的生产。MES还要提供资源使用情况的历史记录，确保设备能够正确安装和运转，以提供实时的状态信息。对这些资源的管理，还包括为满足作业排程计划目标对其所有的预定和调度。

2. 运作/详细调度

在具体生产单元中，根据相关的优先级、属性、特征及配方提供作业排程功能。例如，当根据形状和其他特征对颜色顺序进行合理排序时，可大限度缩短生产过程的准备时间。但这个调度功能的能力有限，它主要是通过识别替代性、重叠性或并行性操作来准确计算出时间、设备上下料，以做出相应调整来适应变化。

3. 生产单元分配

以作业、订单、批量、成批和工单等形式管理生产单元间工作的流动。分配信息用于作业顺序的定制及车间有事件发生时的实时变更。生产单元分配功能具有变更车间已制订的生产计划的能力，对返修和废品进行处理，用缓冲区管理的方法控制任意位置的在制品数量。

4. 文档管理

管理生产单元有关的记录和表格，包括工作指令、配方、工厂图样、标准工艺规程、零件的数控加工程序、批量加工记录、工程更改通知及班次间的通信记录，并提供了按计划编辑信息的功能。它将各种指令下达给操作层，包括向操作者提供操作数据或向设备控制层提供生产配方。

5. 数据采集

通过数据采集接口来获取生产单元的记录和表格上填写各种作业生产数据和参数，这些数据可从车间以手工方式录入或自动从设备上获取按分钟实时更新

6. 质量管理

对生产过程中获得的测量值进行实时分析，以保证产品质量得到良好控制，质量问题得到确切关注。该功能还可针对质量问题推荐相关纠正措施，包括对症状、行为和结果进行关联以确定问题原因。MES111质量管理还包括对统计过程和统计质量控制的追溯。

7. 过程管理

监控生产的整个过程，自动纠错或向用户提供决策支持以纠正和改进制造过程活动。这些活动具有内操作性，主要集中在被监控的机器和设备上，同时具有操作性，跟踪从一项到另外一项作业流程；还有报警功能，使车间人员能及时察觉到出现了超出允许误差的过程更改；同时，还可以实现智能设备与MES系统之间的数据交换。

8. 维护管理

跟踪和指导作业活动，维护设备和工具以确保它们能正常运行并安排进行定期检修，以及对突发问题能及时响应或报警，同时还保留了以往的维修记录和问题，帮助技术人员进行问题诊断。

9. 性能分析

按分钟更新实际生产运行结果的报告信息，对过去记录和预售结果进行比较，运行性能结果包括资源利用率、资源可获取性、产品单位周期、与排程表的一致性，与标准的一致性等指标的测量值。

10. 产品追溯

提供工件在任何时候都位置和状态信息，其状态信息包括进行该工作的人员信息，以及功按供应商划分的组成物料、生产批号、序列号。当前生产情况、警告、返工或产品相关的异常信息。在线跟踪可创建一个历史记录，使得零件和每个末端产品的使用具有可追溯性。